RExMap: o bază de date exactă pentru cartografierea microbilor la nivel de specie

RExMap: o bază de date exactă pentru cartografierea microbilor la nivel de specie

©

Autor:

RExMap: o bază de date exactă pentru cartografierea microbilor la nivel de specie
Un nou studiu de cercetare a dezvoltat o bază de date exactă de cartografiere bazată pe referinÈ›e (RExMap) pentru a cartografia microbii la nivel de specie. Baza de date a fost derivată din peste 170.000 de genomi de tulpini izolate microbiene obÈ›inute din baza de date NCBI Genome. Abordarea cercetătorilor a permis dezvoltarea unui peisaj detaliat al microbiomului intestinal uman, reprezentând zeci de mii de microbi unici.
Studiul actual a utilizat RExMap pentru a reanaliza datele existente ale microbiomului intestinal uman 16S de la peste 29.000 de indivizi din zece studii efectuate în diferite regiuni ale lumii. Cercetătorii au observat că microbii intestinali umani diferă în funcÈ›ie de regiunile lumii. În special, unii microbi intestinali se găsesc din abundență într-o anumită regiune.

În plus, un set de microbi de bază au fost descoperiÈ›i la niveluri de specii care sunt împărÈ›ite în mod obiÈ™nuit între oameni, independent de stilul de viață, mediu sau regiunile geografice. DiferenÈ›ele observate pot avea un impact semnificativ asupra sănătății umane È™i pot oferi oportunități pentru dezvoltarea unor terapii personalizate pentru bolile legate de microbiomul intestinal.

Cu toate acestea, RExMap are câteva limitări, inclusiv capacitatea sa redusă de cartografiere a speciilor microbiene prezente în niÈ™e cu puÈ›ine tulpini, cum ar fi ecosistemele acvatice È™i de sol. În plus, există o limitare în cartografierea microbilor cărora le lipseÈ™te 16S complet sau secvenÈ›a genomică.

sursa: News Medical
foto: SciePro / Shutterstock

Data actualizare: 25-04-2023 | creare: 25-04-2023 | Vizite: 568
Bibliografie
RExMap unlocks gut microbiome secrets: Revealing their global influence on health, link: https://www.news-medical.net/news/20230421/RExMap-unlocks-gut-microbiome-secrets-Revealing-their-global-influence-on-health.aspx
©

Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!


Din Biblioteca medicală vă mai recomandăm:
Din Ghidul de sănătate v-ar putea interesa și:
  • ÃŽnÈ›elegerea modului în care microbiomul se dezvoltă la oameni
  • Alimentele ultraprocesate afectează microbiomul intestinal: corelaÈ›ia este confirmată de o nouă recenzie
  • Un remediu natural asiatic, eficient în reducerea simptomelor colitei
  • Forumul ROmedic - întrebări È™i răspunsuri medicale:
    Pe forum găsiți peste 500.000 de întrebări și răspunsuri despre boli sau alte subiecte medicale. Aveți o întrebare? Primiți răspunsuri gratuite de la medici.
      intră pe forum