Varianta Omicron a virusului SARS-CoV-2 ar putea să nu evite neutralizarea anticorpilor

În ciuda unor mutații evidențiate în domeniului de legare a receptorilor spike (RBD), noua variantă a virusului SARS-CoV-2 nu este capabilă să scape complet de răspunsurile imune ale gazdei, conform unor studii de modelare computațională conduse de cercetătorii de la Universitatea din Carolina de Nord.
Varianta Omicron a SARS-CoV-2, identificată pentru prima dată în Africa de Sud, a fost desemnată de către Organizația Mondială a Sănătății variantă de îngrijorare, în principal din cauza numărului mare de mutații observate în proteină spike, în special în domeniului de legare a receptorilor spike. Analiza de secvențiere a întregului genom a dezvăluit că varianta este puternic mutată, cu 37 de mutații în proteina spike și 15 mutații în special în vârful RBD. Cu toate acestea, până la momentul actual nu sunt suficiente dovezi disponibile pentru a înțelege infecțiozitatea, transmisibilitatea, patogenitatea și capacitatea de evadare imună a variantei Omicron.

În studiul actual, oamenii de știință au prezis computațional structura RBD a proteină spike Omicron din secvențele disponibile. Folosind structura prezisă, au explorat dinamica interacțiunilor antigen-anticorp. Cercetătorii au folosit AlphaFold, un program de inteligență artificială, pentru a prezice afinitatea de legare a interacțiunilor antigen-anticorp.

Analiza de legare a anticorpilor a arătat că domeniului de legare a receptorilor spike ai variantei Omicron are o afinitate de legare mai mică pentru fiecare anticorp testat, în comparație cu domeniului de legare a receptorilor spike al variantei inițiale a virusului. Studiul arată că, în ciuda dobândirii a 60 de mutații în RBD, varianta Omicron nu este capabilă să scape complet de neutralizarea mediată de anticorpi. Există, însă, o reducere a afinității de legare observată între varianta Omicron și anticorpii testați.

sursa: News Medical