Învățarea automată ajută la descoperirea peptidelor antimicrobiene în microbiomul global

Infecțiile rezistente la antibiotice sunt din ce în ce mai dificil de tratat cu terapiile convenționale, determinând moartea a 1,27 milioane de persoane anual. Acest fapt subliniază necesitatea urgentă de a descoperi noi antibiotice, inclusiv peptide antimicrobiene (AMP), prin metode noi, cum ar fi abordările computaționale.
Utilizând tehnici de învățare automată, un studiu condus de o echipă internațională a explorat 63.410 metagenomuri și 87.920 genomuri microbiale de înaltă calitate disponibile public pentru a prezice și cataloga AMP din microbiomul global. Acest proces a dus la crearea AMPSphere, o colecție de 863.498 secvențe peptidice ne-redundante, care include peptide candidate antimicrobiene (c_AMP) derivate din date (meta)genomice.

Rezultate

Dintre aceste c_AMP, majoritatea nu fuseseră descrise anterior. Analiza a relevat că aceste c_AMP sunt specifice anumitor habitate și în mare parte nu sunt gene centrale în pangenom. Aproximativ 20% dintre aceste secvențe au fost detectate în metaproteome sau metatranscriptome independente, indicând că nu sunt artefacte. Cercetările ulterioare au arătat că aceste peptide sunt active împotriva patogenilor ESKAPEE, cunoscuți pentru relevanța lor clinică în sănătatea publică.

Descoperirile sugerează un potențial imens pentru descoperirea de AMP noi din microbiomul global, care ar putea juca un rol crucial în dezvoltarea de noi tratamente antimicrobiene. Aceste peptide ar putea fi utilizate pentru a combate rezistența crescândă la antibioticele convenționale, oferind o nouă clasă de antimicrobiene cu un spectru larg de activitate și rate scăzute de dezvoltare a rezistenței.

Concluzii

Utilizarea învățării automate pentru a identifica AMP din microbiomul global reprezintă un avans semnificativ în căutarea soluțiilor la criza antibioticelor. Rezultatele acestui studiu subliniază importanța continuării explorării microbiomului la scară largă și a diversității sale enorme pentru descoperirea de noi compuși antimicrobieni eficace. Peptidele identificate pot juca un rol vital în dezvoltarea de noi terapii antimicrobiene și în înțelegerea mai amplă a dinamicii microbiomului.

sursa: Science Daily
foto: Associate Professor Luis Pedro Coelho, Queensland University of Technology

Data actualizare: 07-06-2024 | creare: 07-06-2024 | Vizite: 341

Bibliografie

Unlocking the world around us for next-gen antibiotics, link: https://www.sciencedaily.com/releases/2024/06/240605162428.htm

Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!

Alte articole din aceeași secțiune:

Oamenii de știință creează noi instrumente pentru controlul electronic al expresiei genelor

Într-un nou studiu al cercetătorilor de la Imperial College London, aceștia au dezvoltat o nouă tehnologie de m...

Terapia genetică avansată poate preveni pierderea severă a masei musculare la persoanele vârstnice

Folosind terapia genetică avansată, oamenii de știință de la Institutul Tehnologic din Trondheim au reușit s�...

De ce unele celule, deși au gene identice, acționează diferit?

Oamenii de știință au făcut o descoperire importantă care explică cum și de ce miliardele de celule diferite...

Noi cercetări relevă modul în care un grup de molecule mențin organismul uman în funcțiune
Astmul, febra fânului și eczemele au peste 100 de mutații genetice comune (Studiu)
Consumul de cafea este influențat genetic
O genă a longevității protejează celulele stem neurale împotriva stresului

Din Biblioteca medicală vă mai recomandăm:

Germenii și rezistența lor la antibiotice

Din Ghidul de sănătate v-ar putea interesa și:

Prescrierea de mai puține antibiotice pentru tuse și răceli nu aduce complicații majore

În cadrul cercetărilor despre rezistența la antibiotice, oamenii de știință de la Kings College London a...

Acum puteti urmări în timp real dezvoltarea rezistenței la antibiotice

Rezistența la antibiotice este una dintre cele mai înfricoșătoare provocări ale omenirii, pe măsură ce apar ...

Bacterie izolată timp de 4 milioane de ani - rezistentă la 18 tipuri de antibiotice

În timp ce problemele din spitale și fermele de animale sunt determinate de utilizarea excesivă a medicamentelor...

Cele mai periculoase bacterii rezistente la antibiotice, conform OMS

Prevenirea rezistenței la antibiotice – Ghid pentru pacienți!

Efectele secundare ale administrării nejustificate a antibioticelor

Forumul ROmedic - întrebări și răspunsuri medicale:

Pe forum găsiți peste 500.000 de întrebări și răspunsuri despre boli sau alte subiecte medicale. Aveți o întrebare? Primiți răspunsuri gratuite de la medici.

Rezistenta antibiotice

intră pe forum