Învățarea automată ajută la descoperirea peptidelor antimicrobiene în microbiomul global

Învățarea automată ajută la descoperirea peptidelor antimicrobiene în microbiomul global

©

Autor:

Învățarea automată ajută la descoperirea peptidelor antimicrobiene în microbiomul global
InfecÈ›iile rezistente la antibiotice sunt din ce în ce mai dificil de tratat cu terapiile convenÈ›ionale, determinând moartea a 1,27 milioane de persoane anual. Acest fapt subliniază necesitatea urgentă de a descoperi noi antibiotice, inclusiv peptide antimicrobiene (AMP), prin metode noi, cum ar fi abordările computaÈ›ionale.
Utilizând tehnici de învățare automată, un studiu condus de o echipă internaÈ›ională a explorat 63.410 metagenomuri È™i 87.920 genomuri microbiale de înaltă calitate disponibile public pentru a prezice È™i cataloga AMP din microbiomul global. Acest proces a dus la crearea AMPSphere, o colecÈ›ie de 863.498 secvenÈ›e peptidice ne-redundante, care include peptide candidate antimicrobiene (c_AMP) derivate din date (meta)genomice.

Rezultate

Dintre aceste c_AMP, majoritatea nu fuseseră descrise anterior. Analiza a relevat că aceste c_AMP sunt specifice anumitor habitate È™i în mare parte nu sunt gene centrale în pangenom. Aproximativ 20% dintre aceste secvenÈ›e au fost detectate în metaproteome sau metatranscriptome independente, indicând că nu sunt artefacte. Cercetările ulterioare au arătat că aceste peptide sunt active împotriva patogenilor ESKAPEE, cunoscuÈ›i pentru relevanÈ›a lor clinică în sănătatea publică.

Descoperirile sugerează un potenÈ›ial imens pentru descoperirea de AMP noi din microbiomul global, care ar putea juca un rol crucial în dezvoltarea de noi tratamente antimicrobiene. Aceste peptide ar putea fi utilizate pentru a combate rezistenÈ›a crescândă la antibioticele convenÈ›ionale, oferind o nouă clasă de antimicrobiene cu un spectru larg de activitate È™i rate scăzute de dezvoltare a rezistenÈ›ei.

Concluzii

Utilizarea învățării automate pentru a identifica AMP din microbiomul global reprezintă un avans semnificativ în căutarea soluÈ›iilor la criza antibioticelor. Rezultatele acestui studiu subliniază importanÈ›a continuării explorării microbiomului la scară largă È™i a diversității sale enorme pentru descoperirea de noi compuÈ™i antimicrobieni eficace. Peptidele identificate pot juca un rol vital în dezvoltarea de noi terapii antimicrobiene È™i în înÈ›elegerea mai amplă a dinamicii microbiomului.

sursa: Science Daily
foto: Associate Professor Luis Pedro Coelho, Queensland University of Technology

Data actualizare: 07-06-2024 | creare: 07-06-2024 | Vizite: 341
Bibliografie
Unlocking the world around us for next-gen antibiotics, link: https://www.sciencedaily.com/releases/2024/06/240605162428.htm
©

Copyright ROmedic: Articolul se află sub protecția drepturilor de autor. Reproducerea, chiar și parțială, este interzisă!

Alte articole din aceeași secțiune:

Din Biblioteca medicală vă mai recomandăm:
Din Ghidul de sănătate v-ar putea interesa și:
  • Cele mai periculoase bacterii rezistente la antibiotice, conform OMS
  • Prevenirea rezistenÈ›ei la antibiotice – Ghid pentru pacienÈ›i!
  • Efectele secundare ale administrării nejustificate a antibioticelor
  • Forumul ROmedic - întrebări È™i răspunsuri medicale:
    Pe forum găsiți peste 500.000 de întrebări și răspunsuri despre boli sau alte subiecte medicale. Aveți o întrebare? Primiți răspunsuri gratuite de la medici.
      intră pe forum