Cercetătorii descoperă cum se comportă proteinele în interiorul celulelor folosind inteligența artificială

Cercetătorii de la Universitatea Cambridge au dezvoltat un atlas al proteinelor care descrie comportamentul acestora în celulele umane, publicat în Nature Communications. Acest atlas este conceput să ajute în cercetarea originilor bolilor asociate cu comportamentul anormal al proteinelor, cum ar fi demența și multe tipuri de cancer.
Atlasul identifică noi proteine responsabile pentru diverse funcții vitale ale corpului, focalizându-se pe o parte specifică a celulei numită condensat. Aceste condensate sunt considerate hub-uri esențiale unde proteinele se organizează și unde pot începe procesele patologice.

Echipa, condusă de profesorul Tuomas Knowles, a utilizat inteligența artificială pentru a prezice interacțiunile dintre proteine în cadrul acestor condensate, folosind baze de date extinse precum StringDB și BioGRID. Această metodologie le-a permis să exploreze complexitatea condensatelor proteice la un nivel mai profund decât cercetările anterioare.

Dr. Kadi Liis Saar, autorul principal și cercetător postdoctoral la Centre for Misfolding Diseases, subliniază că atlasul poate caracteriza peisajul complet al unei celule, permițând predicții despre localizarea fiecărei proteine și interacțiunile acesteia cu alte proteine. Aceasta deschide noi posibilități pentru intervenții în bolile asociate cu formarea anormală a condensatelor.

Descoperirile includ identificarea proteinelor în condensate care nu au fost observate anterior în astfel de locații, implicându-se în funcții corporale importante, cum ar fi distribuția grăsimilor și crearea de actină și proteine noi în celule. Aceste descoperiri noi oferă speranțe pentru o înțelegere mai amplă a rolurilor biologice ale condensatelor și a mecanismelor biofizice care stau la baza formării acestora.

sursa: Science Daily
foto: Microtubuli care evidențiază corpul celular (violet) cu nucleu (galben) și condensate (albastru). Andrew Seeber