Analiza bioinformatică identifică căile implicate în infecția intestinală cu SARS-CoV-2

Virusul SARS-CoV-2 are capacitatea de a infecta tractul digestiv, studiile raportând prezența în fecalele pacienților infectați a particulelor virale. Cu toate acestea, efectul SARS-CoV-2 asupra tractului digestiv uman este un subiect slab cercetat. Un nou studiu, condus de cercetători din China, explorează bolile cauzate de infecția cu virusul SARS-CoV-2 în tractul digestiv uman.
Cercetătorii au folosit analiza bioinformatică pentru a identifica și examina expresia diferențială a microorganismelor în diferite condiții și au folosit, de asemenea, analiza ontologiei genelor (GO) și Enciclopedia Kyoto a Genelor și Genomurilor (KEGG) pentru a stabili semnificația biologică a screening-ului genelor exprimate diferențial (DEG). Autorii studiului au grupat persoanele infectate în funcție de timpul de infectare (la 24 de ore de la infectare sau la 60 de ore de la infectare).

Analiza procesului biologic a demonstrat că screening-ul genelor exprimate diferențial au fost considerabil îmbogățite în diviziunea nucleară, diviziunea nucleară mitotică, segregarea cromatidelor surori mitotice, reglarea negativă a ciclului celular și segregarea cromozomilor la 24 de ore de la infectare.

Rezultatele au identificat nouă gene hub semnificative statistic, ce au fost analizate folosind bioinformatică. Două dintre genele identificate, ATK1 și TIMP1, prezintă un anumit efect stimulator asupra celulelor imune, inclusiv asupra macrofagelor și declanșează răspunsurile imune, ceea ce indică faptul că SARS-CoV-2 poate provoca boli inflamatorii intestinale severe, diaree, febră și alte simptome post-infecție și, eventual, duce la afectarea sistemului gastrointestinal.

Alte gene identificate, genele TTK, BUB1B, PLK1 și CCNA2, au roluri semnificative în ciclul normal de diviziune celulară. Reglarea acestor patru gene în timpul infecției cu SARS-CoV-2 nu numai că oferă condiții favorabile pentru transmiterea virală, dar evidențiază și posibilitatea apariției anomaliilor cromozomiale și a altor leziuni genetice în celulele gazdă.

Concluziile studiului actual oferă o direcție și o bază pentru studii ulterioare privind infecția cu SARS-CoV-2 a tractului digestiv uman, oferind în același timp noi perspective pentru prevenirea și tratamentul bolilor asociate cu infecția cu SARS-CoV-2.

sursa: News Medical