Către un singur medicament pentru tratamentul tuturor coronavirusurilor

Vaccinurile sigure și eficiente oferă speranța unui sfârșit al pandemiei COVID-19. Cu toate acestea, posibilitatea apariției unor variante de virus SARS-CoV-2 rezistente la vaccinuri, dar și a altor noi coronavirusuri fac mai importantă ca niciodată găsirea unor tratamente eficiente împotriva tuturor acestor virusuri.
Acum, cercetătorii raportează în publicația Journal of Proteome Research a Societății Americane de Chimie că au analizat proteine virale aparținând a 27 de specii de coronavirusuri, precum și mii de probe de la pacienți cu COVID-19, identificând secvențe înalt conservate care ar putea deveni cele mai bune ținte terapeutice.

Medicamentele se leagă adesea de interiorul unor buzunare ale proteinelor ce țin strâns agentul terapeutic, ceea ce interferă cu funcția proteinei. Cu ajutorul structurilor 3D ale proteinelor virale se pot identifica potențiale buzunare pentru legarea medicamentelor, deși în timp se pot produce mutații ale proteinelor respective și medicamentele nu se mai pot lega corespunzător.

Totuși, anumite buzunare sunt esențiale pentru funcția proteinei, încât nu se pot modifica, iar aceste secvențe sunt în general conservate de-a lungul timpului la virusuri.

Matthieu Schapira și colegii săi au folosit probe de la pacienți infectați cu SARS-CoV-2 sau alte coronavirusuri și au descoperit astfel cele mai promițătoare ținte pentru medicamente care să acționeze asupra mai multor coronavirusuri.

Echipa a folosit un algoritm pe calculator pentru a identifica buzunare specifice în structura a 15 proteine ale SARS-CoV-2. S-au găsit apoi proteinele corespunzătoare în 27 de specii de coronavirusuri și s-au comparat secvențele din buzunarele ce pot lega medicamente.

Două porțiuni au fost cel mai bine conservate, și anume un buzunar ce conține locul de legare la ARN al helicazei nsp13, precum și un buzunar cu situsul catalitic al ARN-polimerazei ARN dependente nsp12. Aceste două proteine sunt implicate în replicarea virală și în transcripție.

De asemenea, buzunarul de pe nsp13 a fost cel mai bine conservat în mii de probe cu SARS-CoV-2, la nivelul lui negăsindu-se nicio mutație.

Cercetătorii spun că noile medicamente antivirale care au ca țintă situsul catalitic al nsp12 sunt deocamdată în faza 2 și 3 ale studiilor clinice, iar situsul de legare la ARN al nsp13 este o țintă neexplorată până acum ce ar trebui să fie prioritară pentru obținerea unui nou medicament.

sursa: Science Daily